دوره آموزشی
The Great Courses
دوبله زبان فارسی

تحلیل داده‌ بیوانفورماتیک - تسلط به پایتون، R و لینوکس

تحلیل داده‌ بیوانفورماتیک - تسلط به پایتون، R و لینوکس

✅ سرفصل و جزئیات آموزش

آنچه یاد خواهید گرفت:

  • اصول زبان‌های اسکریپت‌نویسی پایتون، R و Bash - مبانی این زبان‌ اسکریپت‌نویسی شامل سینتکس، تایپ‌های داده، متغیرها و ساختارهای کنترل را یاد می‌گیرید.
  • استخراج و دستکاری داده‌ - با نحوه تجزیه و دستکاری انواع مختلف داده‌ زیستی مانند توالی‌های DNA، ساختارهای پروتئین و پروفایل‌های بیان ژن آشنا می‌شوید.
  • مصورسازی داده‌ - روش‌های مصورسازی داده‌ زیستی با استفاده از پایتون و R، از جمله ایجاد نمودارها، گراف‌ها و چارت‌ها برای کسب بینش‌ها از داده‌ را می‌آموزید.
  • تحلیل آماری - تکنیک‌های تحلیل آماری در R برای بررسی مجموعه داده‌‌های زیستی، شامل آزمون فرضیه، تحلیل رگرسیون و خوشه‌بندی را مطالعه می‌کنید.
  • اتوماسیون و توسعه پایپ‌لاین - با اسکریپت‌نویسی Bash یاد می‌گیرید چگونه تسک‌های تکراری را خودکار کرده و پایپ‌لاین‌های پردازش داده‌ کارآمد بسازید.
  • پروژه‌های واقعی تحلیل داده - مهارت‌های آموخته شده را با مجموعه داده‌‌های زیستی واقعی به کار می‌برید و تجربه عملی در تحلیل بیوانفورماتیک کسب می‌کنید.
  • بهترین شیوه‌های اسکریپت‌نویسی بیوانفورماتیک - بهترین شیوه‌ها برای نوشتن اسکریپت‌های تمیز، بهینه و قابل نگهداری در تحلیل‌های بیوانفورماتیک را می‌آموزید.

پیش‌نیازهای دوره

  • دانش اولیه زیست‌شناسی - آشنایی با مفاهیم اساسی زیستی مانند DNA، ژن‌ها، پروتئین‌ها و فرآیندهای زیستی
  • توانمندی‌های کامپیوتری - آشنا به کار با کامپیوتر و نرم‌افزارهای اولیه - تجربه قبلی برنامه‌نویسی لازم نیست.
  • آشنایی با خط فرمان - آشنایی اولیه با رابط خط فرمان (مانند ناوبری در دایرکتوری‌ها و اجرای فرمان‌ها) مفید است ولی اجباری نیست.
  • الزامات سخت‌افزاری و نرم‌افزاری - دسترسی به کامپیوتری با اتصال اینترنت و توانایی نصب نرم‌افزارهای مورد نیاز دوره (پایتون، R و Bash)

توضیحات دوره

به دوره «اسکریپت‌نویسی بیوانفورماتیک - از تجزیه داده تا تحلیل» خوش آمدید، دوره‌ای جامع که مهارت‌های ضروری در پایتون، R و اسکریپت‌نویسی Bash را برای پردازش و تحلیل مؤثر داده‌ زیستی به شما می‌آموزد.

در حوزه سریعا در حال تحول بیوانفورماتیک، توانایی تحلیل و تفسیر موثر داده‌ زیستی اهمیت زیادی دارد. این دوره به شما کمک می‌کند با زبان‌های اسکریپت‌نویسی پرکاربرد این حوزه - پایتون، R و Bash - آشنا شوید و آنها را روی مجموعه داده‌‌های زیستی واقعی اعمال کنید.

دوره با مقدمه‌ای بر اصول پایتون، R و اسکریپت‌نویسی Bash همراه است که شامل سینتکس اولیه، ساختارهای داده و کنترل جریان می‌باشد. سپس خواهید آموخت چگونه انواع داده‌ زیستی مثل توالی‌های DNA، ساختارهای پروتئین و پروفایل‌های بیان ژن را با این زبان‌های اسکریپت‌نویسی، تجزیه کنید.

در ادامه، مباحث پیشرفته‌ مانند مصورسازی داده، تحلیل آماری و یادگیری ماشین در پایتون و R را بررسی خواهید کرد. همچنین نحوه اتوماسیون تسک‌های تکراری و ساخت پایپ‌لاین‌های پردازش داده کارآمد با اسکریپت‌نویسی Bash را نیز یاد خواهید گرفت.

در پایان دوره، مهارت‌ها و اعتمادبه‌نفس لازم برای حل مسائل پیچیده بیوانفورماتیک و انجام تحلیل‌های معنادار روی داده‌ زیستی را خواهید داشت. چه زیست‌شناس باشید که می‌خواهد مهارت‌های محاسباتی خود را ارتقا دهد و چه برنامه‌نویسی که علاقه‌مند به اعمال دانش خود در تحقیقات زیستی است، این دوره دانش و ابزارهای مورد نیاز برای موفقیت در بیوانفورماتیک را در اختیار شما قرار می‌دهد.

با ما همراه شوید و مهارت‌های بیوانفورماتیک خود را به سطح بعدی ببرید!

این دوره برای چه کسانی مناسب است؟

  • زیست‌شناسان - کسانی که می‌خواهند مهارت‌های محاسباتی خود را بهبود دهند و یاد بگیرند چگونه داده‌ زیستی را با زبان‌های اسکریپت‌نویسی تحلیل کنند.
  • برنامه‌نویسان - افراد علاقه‌مند به کاربرد مهارت‌های برنامه‌نویسی در تحقیقات زیستی و شناخت چالش‌های خاص تحلیل داده‌ بیوانفورماتیک
  • دانشجویان - دانشجویان بیوانفورماتیک، زیست‌شناسی، علوم کامپیوتر یا رشته‌های مرتبط که می‌خواهند مهارت‌های عملی اسکریپت‌نویسی بیوانفورماتیک را کسب کنند.
  • حرفه‌ای‌ها - فعالان حوزه بیوانفورماتیک که به‌ دنبال بروزرسانی مهارت‌های خود و یادگیری تکنیک‌های جدید تحلیل داده هستند.
  • علاقه‌مندان به بیوانفورماتیک - افرادی که به موضوع بیوانفورماتیک علاقه دارند و می‌خواهند بیشتر درباره نحوه تحلیل داده‌ زیستی با زبان‌های اسکریپت‌نویسی بدانند.

تحلیل داده‌ بیوانفورماتیک - تسلط به پایتون، R و لینوکس

  • آشنایی با اسکریپت‌نویسی بیوانفورماتیک 08:48
  • آشنایی با لینوکس (Bash برای بیوانفورماتیک) 18:40
  • آشنایی با لینوکس (Bash برای بیوانفورماتیک) - راهنمای مبتدی 01:09
  • ابزارهای E-utilities NCBI در bash (تحلیل توالی) 16:43
  • ابزارهای معروف بیوانفورماتیک (مقدمه و نصب) 09:09
  • Blast برای لینوکس (همولوژی توالی‌ها) 12:16
  • تحلیل هم‌ترازی توالی‌ها 05:59
  • تحلیل فیلوژنتیک (ساخت درخت) 14:24
  • معرفی گیت‌هاب 11:04
  • راه‌اندازی پروفایل و اولین مخزن 12:18
  • جستجوی پروژه‌های بیوانفورماتیک 08:13
  • کلون‌سازی و فورک کردن مخازن 15:21
  • همکاری در گیت‌هاب 06:34
  • گیت‌هاب برای مدیریت پروژه 07:21
  • مقدمه و دلیل استفاده از CLI در بیوانفورماتیک 06:02
  • توضیح CLI و GUI 03:24
  • اگر سیستم رابط کاربری گرافیکی داریم، چرا باید از CLI استفاده کنیم؟ 07:07
  • تمرین کوتاه با زبان برنامه‌نویسی 03:15
  • چرا باید CLI را به جای GUI استفاده کرد؟ 03:44
  • توضیح اصول پشت شل CLI 07:40
  • معایب CLI و GUI 02:53
  • مقدمه‌ لینوکس و کاربرد آن در طول سال‌ها 05:29
  • توزیع‌های لینوکس 05:03
  • چرا سیستم‌عامل اوبونتو؟ 03:20
  • توضیح WSL 02:05
  • لینوکس در مقابل و یونیکس 04:21
  • عملی - ساخت Subsystem لینوکس در سیستم‌ عامل ویندوز 05:06
  • فرمان‌های مدیریت فایل لینوکس 11:05
  • دسترسی و ایجاد فایل‌ها در سیستم‌ عامل ویندوز 03:28
  • فرمان‌های اولیه مدیریت فرآیند در سیستم‌ عامل لینوکس 07:07
  • مقدمه E-Direct 03:44
  • نصب NCBI از طریق CLi 01:19
  • توابع Entrez Direct 02:17
  • بازیابی توالی‌های mRNA و پروتئین 03:08
  • بازیابی دسته‌ای پروتئین‌ها با استفاده از شناسه تاکسون 02:09
  • بازیابی CDS از ژنوم مرجع 01:16
  • توضیح فرمان‌های مختلف 01:13
  • مقدمه 04:55
  • دریافت خوانش‌های SRA 08:18
  • بررسی کیفیت داده‌ 07:39
  • Trim کردن کیفیت داده‌ 04:34
  • Aligners و ترازبندی خوانش‌ها به ژنوم 12:48
  • ایندکس‌گذاری و مرتب‌سازی فایل‌ SAM و BAM 07:15
  • استخراج ویژگی 08:43
  • مقدمه 03:51
  • انواع واریانت‌ها 07:20
  • درک متادیتا و نرم‌افزارها 05:22
  • دریافت داده از SRA با استفاده از ابزار جعبه ابزار SRA 07:18
  • کنترل کیفیت و Trimming 09:46
  • ابزارهای Sam و Bcf، فیکس کردن NS و فراخوانی واریانت‌ها 07:49
  • ترازبندی به ژنوم مرجع 10:15
  • جداسازی واریانت‌های SNP و Indel 05:17
  • مصورسازی واریانت‌ها با استفاده از IGV و مرورگر UCSC 03:37
  • آشنایی با بیوانفورماتیک و دلیل استفاده از پایتون 09:17
  • مقدمه‌ BioPython 09:58
  • راه‌اندازی محیط کدنویسی 14:02
  • توضیح کتابخانه‌های مورد استفاده در دوره 15:25
  • فرمت‌های پیشرفته فایل در بیوانفورماتیک با BioPython 19:23
  • تحلیل توالی با استفاده از Biopython 16:17
  • دسترسی و بازیابی پایگاه داده‌ با استفاده از Biopython 11:33
  • کار با ژنوم‌ها با استفاده از Biopython 19:08
  • ساخت درخت فیلوژنتیک با استفاده از Biopython 14:09
  • تحلیل پروتئومیکس با استفاده از Biopython 19:56
  • یادگیری ماشین در بیوانفورماتیک 11:45
  • آشنایی با بیوانفورماتیک و R - بررسی تلاقی علوم زیستی 08:02
  • شروع کار با R - نصب و آشنایی با متغیرها 10:15
  • کار با پکیج‌های R - نصب، بارگذاری و بررسی ابزارهای بیوانفورماتیک 09:34
  • تحلیل بیان ژن تفاضلی با Deseq2 - آماده‌سازی داده‌ 05:27
  • درک کد Deseq2 17:43
  • تبدیل شناسه‌های ژنی Ensembl به نمادهای ژن - استفاده از تکنیک‌ها و پکیج‌های R 11:30
  • مصورسازی داده‌ بیان ژن - ایجاد نمودارهای خیره‌کننده با ggplot2 10:14
  • آشنایی با تحلیل داده‌ توالی‌یابی RNA تک‌ سلولی (scRNA-seq) 07:15
  • بررسی کد scRNA-seq - مسیرهای سلولی و پویایی بیان ژن 21:55
  • مقدمه‌ میکرواری 18:49
  • پایگاه داده‌های میکرواری 12:20
  • تحلیل میکرواری با استفاده از GEO2R 18:33
  • تحلیل میکرواری در R 33:45

7,395,200 1,848,800 تومان

مشخصات آموزش

تحلیل داده‌ بیوانفورماتیک - تسلط به پایتون، R و لینوکس

  • تاریخ به روز رسانی: 1404/12/10
  • سطح دوره:متوسط
  • تعداد درس:78
  • مدت زمان :12:24:29
  • حجم :5.98GB
  • زبان:دوبله زبان فارسی
  • دوره آموزشی:AI Academy

آموزش های مرتبط

The Great Courses
1,833,000 366,600 تومان
  • زمان: 02:27:39
  • تعداد درس: 24
  • سطح دوره:
  • زبان: دوبله فارسی
The Great Courses
2,260,000 452,000 تومان
  • زمان: 03:02:02
  • تعداد درس: 14
  • سطح دوره:
  • زبان: دوبله فارسی
The Great Courses
795,000 159,000 تومان
  • زمان: 58:00
  • تعداد درس: 12
  • سطح دوره:
  • زبان: دوبله فارسی
The Great Courses
19,403,000 3,880,600 تومان
  • زمان: 26:02:40
  • تعداد درس: 175
  • سطح دوره:
  • زبان: دوبله فارسی
The Great Courses
8,508,000 1,701,600 تومان
  • زمان: 11:25:13
  • تعداد درس: 94
  • سطح دوره:
  • زبان: دوبله فارسی
  • سطح دوره:
  • زبان: دوبله فارسی
The Great Courses
6,100,500 1,220,100 تومان
  • زمان: 08:11:21
  • تعداد درس: 28
  • سطح دوره:
  • زبان: دوبله فارسی
The Great Courses
7,256,500 1,451,300 تومان
  • زمان: 09:44:25
  • تعداد درس: 67
  • سطح دوره:
  • زبان: دوبله فارسی
The Great Courses
3,634,500 726,900 تومان
  • زمان: 04:52:43
  • تعداد درس: 38
  • سطح دوره:
  • زبان: دوبله فارسی

آیا سوالی دارید؟

ما به شما کمک خواهیم کرد تا شغل و رشد خود را افزایش دهید.
امروز با ما تماس بگیرید