دوره آموزشی
دوبله زبان فارسی
الگوریتمهای توالییابی DNA
✅ سرفصل و جزئیات آموزش
توضیحات دوره
ما روشهای محاسباتی - الگوریتمها و ساختارهای داده - را برای تحلیل دادههای توالییابی DNA یاد خواهیم گرفت. ما کمی درباره DNA، ژنومی و کاربرد توالییابی DNA یاد میگیریم.
ما از Python برای پیادهسازی الگوریتمها و ساختارهای داده کلیدی و تحلیل ژنومهای واقعی و مجموعههای داده توالییابی DNA استفاده میکنیم.
الگوریتمهای توالییابی DNA
-
معرفی ماژول 1 1:32
-
دوره: چرا این را مطالعه کنیم؟ 4:29
-
دوره: توالییابی DNA در گذشته و حال 3:08
-
دوره: ژنومها به عنوان رشته، خواندنها به عنوان زیررشته 5:02
-
دوره: تعاریف رشته و مثالهای Python 3:33
-
عملی: اصول رشته 7:14
-
عملی: دستکاری رشتههای DNA 7:00
-
عملی: دانلود و تجزیه یک ژنوم 6:29
-
دوره: چگونه DNA کپی میشود؟ 3:37
-
دوره اختیاری: چگونه دستگاههای توالییابی نسل دوم عمل میکنند؟ 7:10
-
دوره اختیاری: خطاهای توالییابی و کیفیت پایه 6:37
-
دوره: خواندنهای توالییابی در قالب FASTQ 4:39
-
عملی: کار با خواندنهای توالییابی 11:11
-
عملی: تحلیل خواندنها بر اساس موقعیت 6:58
-
دوره: توالییابی قطعات را به معماهای ژنوم میدهند 5:41
-
دوره: تطبیق خواندن و دلایل دشواری آن 3:09
-
دوره: تطبیق دقیق ساده 10:18
-
عملی: تطبیق خواندنهای مصنوعی 6:53
-
عملی: تطبیق خواندنهای واقعی 7:24
-
به دوره الگوریتمهای توالییابی DNA خوش آمدید None
-
نظرسنجی پیشدوره None
-
برنامه درسی None
-
راهاندازی Python (و Jupyter) None
-
دریافت اسلایدها و دفترچهها None
-
استفاده از فایلهای داده با برنامههای Python None
-
دستورالعمل تکلیف برنامهنویسی 1 (ابتدا بخوانید) None
-
معرفی هفته 2 1:34
-
دوره: اصول Boyer-Moore 8:50
-
دوره: Boyer-Moore: ترکیب همه 6:15
-
دوره: انحراف: عناصر تکراری 5:02
-
عملی: پیادهسازی Boyer-Moore 10:01
-
دوره: پیشپردازش 7:02
-
دوره: ایندکس و ایندکس k-mer 10:43
-
دوره: ساختارهای مرتب برای ایندکس 8:06
-
دوره: جداول هش برای ایندکس 7:13
-
عملی: پیادهسازی ایندکس k-mer 7:23
-
دوره: تغییرات در ایندکسهای k-mer 9:25
-
دوره: ایندکسهای ژنوم مورد استفاده در تحقیق 9:34
-
دوره: تطبیق تقریبی، هامینگ و فاصله ویرایش 6:53
-
دوره: اصل pigeonhole 6:37
-
عملی: پیادهسازی اصل pigeonhole 9:30
-
دستورالعمل تکلیف برنامهنویسی 2 (ابتدا بخوانید) None
-
معرفی ماژول 3 1:22
-
دوره: حل مسئله فاصله ویرایش 12:31
-
دوره: استفاده از برنامهنویسی پویا برای فاصله ویرایش 12:09
-
عملی: پیادهسازی برنامهنویسی پویا برای فاصله ویرایش 6:21
-
دوره: راهحل جدید برای تطبیق تقریبی 9:17
-
دوره: آشنایی با خانواده: تطبیق سراسری و محلی 10:32
-
عملی: پیادهسازی تطبیق سراسری 8:12
-
دوره: تطبیق خواندن در میدان 4:21
-
دوره: تجمیع: کار از صفر 2:34
-
دوره: قانون اول و دوم تجمیع 8:23
-
دوره: گرافهای Overlap 8:02
-
عملی: Overlap های میان جفتهای خواندن 4:05
-
عملی: پیدا کردن و نمایش تمام Overlap ها 3:47
-
دستورالعمل تکلیف برنامهنویسی 3 (ابتدا بخوانید) None
-
معرفی ماژول 4 1:27
-
دوره: مسئله کوتاهترین ابر رشته مشترک 8:11
-
عملی: پیادهسازی کوتاهترین ابر رشته مشترک 4:30
-
دوره: کوتاهترین ابر رشته مشترک Greedy 7:57
-
عملی: پیادهسازی کوتاهترین ابر رشته مشترک Greedy 7:18
-
دوره: قانون سوم اسمبلی: تکرارها بد هستند 5:58
-
دوره: گرافهای De Bruijn و گامهای اویلری 8:31
-
عملی: ساخت گراف De Bruijn 4:47
-
دوره: زمانی که گامهای اویلری اشتباه میکنند 9:50
-
دوره: اسمبلرها در عمل 8:27
-
دوره: آینده طولانی است؟ 9:36
-
دوره: علوم کامپیوتر و علوم زیستی 5:25
-
دوره: تشکرها 0:43
-
نظرسنجی پسدوره None
مشخصات آموزش
الگوریتمهای توالییابی DNA
- تاریخ به روز رسانی: 1404/09/07
- سطح دوره:
- تعداد درس:70
- مدت زمان :06:40:28
- حجم :968.0MB
- زبان:دوبله زبان فارسی
- دوره آموزشی:AI Academy