تسلط به بیوانفورماتیک: سفر شما از مبتدی به متخصص

آنچه یاد خواهید گرفت:

• درک اساسی: درک محکمی از مفاهیم اساسی بیوانفورماتیک، شامل تحلیل داده، الگوریتم‌ها و تکنیک‌های محاسباتی به دست آورید.
• توسعه مهارت‌های عملی: مهارت‌های عملی در استفاده از ابزارها و نرم‌افزارهای محبوب بیوانفورماتیک برای تسک هایی مانند تحلیل توالی کسب کنید.
• تکنیک‌های یکپارچه‌سازی داده: متدهای پیشرفته برای یکپارچه‌سازی انواع مختلف داده‌ بیولوژیکی را بیاموزید تا رویکردی جامع برای درک داده‌ پیچیده داشته باشید.
• استراتژی‌های حل مسئله: با اعمال رویکردهای بیوانفورماتیک برای حل پرسش‌ها و چالش‌های بیولوژیکی دنیای واقعی، مهارت‌های حل مسئله خود را بهبود دهید.
• تاریخچه و کاربردهای بیوانفورماتیک را یاد خواهید گرفت.
• نمایش اولیه ابزارهای بیوانفورماتیک را یاد خواهید گرفت.
• پایگاه‌های داده مختلف مورد استفاده در بیوانفورماتیک
• تفسیر هم‌ترازی توالی
• ابزارهای مورد استفاده برای هم‌ترازی توالی در بیوانفورماتیک
• متدها و نمایش‌های هم‌ترازی
• استفاده و آشنایی با دسته‌های مختلف زیرپایگاه‌های داده NCBI
• پایگاه‌های داده ژنوم گیاهی
• پایگاه‌های داده ثانویه در بیوانفورماتیک
• مفاهیم اولیه پروتئین
• درک تکنیک‌های مختلف برای پیش‌بینی پروتئین
• درک مدل‌سازی تطبیقی یا همولوژی
• مدل‌سازی پروتئین با استفاده از رابط کاربری گرافیکی 
• آموزش عملی Swiss Model
• مدل‌سازی پروتئین با استفاده از رابط خط فرمان 
• مدل‌سازی پروتئین با استفاده از Modeller
• مبانی توالی‌یابی نسل جدید و چگونگی استفاده از آن برای تحلیل بیان ژن افتراقی از طریق توالی‌یابی RNA
• کنترل کیفیت داده NGS
• Trim کردن ریدهای داده‌ NGS
• ابزارهای مختلف برای هم‌ترازی ریدها با ژنوم
• تحلیل بیان افتراقی
• در نهایت، درک چگونگی استفاده از فناوری‌هایی مانند توالی‌یابی RNA برای شناسایی ژن‌های خاصی که می‌توانند باعث شرایط خاصی شوند.
• تولید نقشه‌حرارتی از نتایج
• تفسیر نتایج تحلیل بیان افتراقی (DEG's)
• آشنایی با مفهوم پایپ‌لاین بیوانفورماتیک
• استفاده از Galaxy برای پردازش داده‌ NGS
• مقدمه‌ای بر زبان برنامه‌نویسی R
• تحلیل داده با استفاده از R
• مقدمه‌ای بر لینوکس
• تحلیل داده با استفاده از لینوکس
• مقدمه‌ای بر پایتون
• تحلیل داده با استفاده از زبان پایتون

توضیحات دوره

برای ورود به یک دوره آموزشی بیوانفورماتیک جامع و عمیق آماده شوید که ارزش هر ریال و ثانیه‌ای از زمان شما را دارد! این برنامه جامع طیف گسترده‌ای از موضوعات بیوانفورماتیک را پوشش می‌دهد و شما را از مرحله مبتدی به سطح متخصص در این حوزه می‌رساند.

این دوره بیوانفورماتیک یک بررسی جامع ارائه می‌دهد که شامل تمام مفاهیم، ابزارها و تکنیک‌های ضروری برای تحلیل و تفسیر داده‌ه بیولوژیکی است.

با یک مقدمه جذاب بر بیوانفورماتیک شروع می‌کنیم، جایی که تاریخچه و توسعه غنی این رشته را بررسی خواهید کرد و نقش محوری آن را در تحقیقات بیولوژی مدرن درک خواهید نمود. کاربردهای متنوع بیوانفورماتیک در ژنومیکس، ترانسکریپتومیکس، پروتئومیکس و متابولومیکس را کشف کرده و شاهد انقلاب آن در این حوزه‌ها خواهید بود.

در بخش بعدی، به پایگاه‌های داده بیولوژیکی می‌پردازیم. در ناوبری و استفاده از انواع مختلف پایگاه‌های داده، از جمله NCBI ،Ensembl و UniProt، مهارت پیدا کنید. هنر جستجوی مؤثر در این پایگاه‌های داده را یاد بگیرید و به مدیریت داده‌ بیولوژیکی مسلط شوید.

خود را برای یک اکتشاف روشنگرانه در فرمت‌های فایل در بیوانفورماتیک آماده کنید. با فرمت‌های فایل رایج مانند FASTA ،FASTQ ،SAM/BAM و VCF آشنا شوید. ابزارها و تکنیک‌های ارزشمند برای دستکاری، تبدیل و تجزیه این فرمت‌ها را کشف کنید، تا به مهارت‌های ضروری برای دستکاری داده مجهز شوید.

در ادامه، به پیچیدگی‌های هم‌ترازی توالی و ابزارها می‌پردازیم. به بررسی اصول زیربنایی هم‌ترازی توالی بپردازید و تجربه عملی با ابزارها و الگوریتم‌های قدرتمندی مانند BLAST ،ClustalW و MUSCLE کسب کنید. یاد بگیرید که نتایج هم‌ترازی را تفسیر و تحلیل کرده و اطلاعات معناداری را از داده‌ خود استخراج نمایید.

بیوانفورماتیک خط فرمان در بخش بعدی جایگاه اصلی را به خود اختصاص می‌دهد. پتانسیل ابزارها و نرم‌افزارهای بیوانفورماتیک را با استفاده از رابط خط فرمان (CLI) آزاد کنید. به فرمان های اولیه یونیکس مسلط شوید، دایرکتوری‌ها را ناوبری کنید، فایل‌ها را ایجاد و ویرایش کنید و ابزارهای بیوانفورماتیک را به طور یکپارچه از خط فرمان اجرا کنید.

در بیوانفورماتیک و ژنومیکس روی GUI و CLI، شما را به یک مجموعه مهارت همه‌کاره مجهز می‌کنیم. یاد بگیرید که چگونه به طور همزمان از رابط‌های کاربری گرافیکی (GUIs) و ابزارهای مبتنی بر CLI استفاده کنید. ابزارهای محبوب بیوانفورماتیک مبتنی بر GUI مانند Geneious و CLC Bio را در کنار ابزارهای مبتنی بر CLI مانند BWA و GATK بررسی کنید. انعطاف‌پذیری لازم برای انتخاب مناسب‌ترین رویکرد برای کارهای بیوانفورماتیکی خود را به دست آورید.

با نزدیک شدن به پایان دوره، به بیوانفورماتیک و پروتئومیکس می‌پردازیم. اصول پروتئومیکس را آشکار کنید و به ابزارها و تکنیک‌های شناسایی، کمّی‌سازی و تحلیل پروتئین‌ها بپردازید. بررسی کنید که چگونه بیوانفورماتیک در پیش‌بینی ساختار و عملکرد پروتئین، و همچنین طراحی داروها و درمان‌ها بر اساس برهم‌کنش‌های پروتئینی کمک می‌کند.

هر بخش از این دوره، تمرین‌های عملی، مثال‌های دنیای واقعی و بینش‌های ارزشمند ارائه می‌دهد. شما با داده‌ بیولوژیکی واقعی کار خواهید کرد، مهارت‌های خود را در تفسیر و مصورسازی نتایج تقویت می‌کنید و درک عمیقی از چالش‌ها و فرصت‌هایی که بیوانفورماتیک ارائه می‌دهد، به دست خواهید آورد.

آیا برای شروع این سفر متحول‌کننده در بیوانفورماتیک آماده‌اید؟ همین امروز در دوره ما شرکت کنید و پتانسیل نامحدود این رشته جذاب را کشف نمایید!

این دوره برای چه کسانی مناسب است؟

• زیست‌شناسان و دانشمندان علوم زیستی: زیست‌شناسان، زیست‌شناسان مولکولی، ژنتیک‌دانان و محققان در علوم زیستی که می‌خواهند مهارت‌های خود را در بیوانفورماتیک تقویت کنند.
• افرادی که به طور کلی به روش‌های تحقیقاتی جدید علاقه دارند و مایل هستند خودشان آن‌ها را امتحان کنند.
• بیوانفورماتیک‌دانان مبتدی که به دنبال درک فرآیند پروتئین‌ها هستند.
• دانشجویان مبتدی بیوانفورماتیک
• افرادی که علاقه‌مند به تحقیق در مورد تأثیرات پاتولوژی‌های مختلف بر بیان ژن یا چگونگی تغییر بیان ژن در طول منحنی رشد یک سلول هستند.
• افرادی که به دنبال انجام تحلیل بیان ژن افتراقی و تحلیل آنتولوژی ژن هستند.
• افرادی که می‌خواهند تحلیل بیوانفورماتیکی را بدون نیاز به کدنویسی پیچیده انجام دهند.
• به محققان توصیه می‌شود که این دوره را بگذرانند.
• متخصصان صنعت که می‌خواهند بیوانفورماتیک یاد بگیرند.