بوت‌کمپ کامل و عملی بیوانفورماتیک: از صفر تا قهرمان

آنچه یاد خواهید گرفت:

• یاد بگیرید که تئوری و نمایش عملی تکنیک‌های بیوانفورماتیک را هم در خط فرمان و هم در رابط کاربری گرافیکی انجام دهید.
• یاد بگیرید که چگونه پایگاه‌های داده بیولوژیکی را بررسی کرده و با استفاده از ابزارها داده‌ را بازیابی کنید.
• یاد بگیرید که چگونه توالی‌های بیولوژیکی را با استفاده از متدهای هم‌ترازسازی جفتی و چندگانه، هم در رابط کاربری گرافیکی و هم در خط فرمان، هم‌تراز کنید.
• یاد بگیرید که چگونه تحلیل‌های ژنومیکس مانند پیش‌بینی ژن‌ها، آنوتاسیون ژنوم، تحلیل اینترون و اگزون، مکان‌یابی ژن و غنی‌سازی ژن را انجام دهید.
• یاد بگیرید که چگونه تحلیل‌های بیوانفورماتیک تکاملی (فیلوژنتیک) را هم در خط فرمان و هم در رابط کاربری گرافیکی انجام دهید.
• یاد بگیرید که چگونه تحلیل‌های بیوانفورماتیک پروتئومیکس مانند پیدا کردن موتیف‌ها و دامنه‌ها، پارامترهای فیزیکی پروتئین، تعامل پروتئین-پروتئین و غنی‌سازی پروتئین را انجام دهید.
• درباره بیوانفورماتیک ساختاری بیاموزید، جایی که مدل‌سازی همولوژی را در پلتفرم‌های GUI و CLI یاد خواهید گرفت و همچنین قادر به پیش‌بینی ساختار سه‌بعدی پروتئین‌ها خواهید بود.
• یاد بگیرید که چگونه از خط فرمان در بیوانفورماتیک استفاده کنید، چگونه از زیرسیستم لینوکس در ویندوز استفاده کنید، و برخی از کاربردهای اساسی bash را بیاموزید و تحلیل جستجو در پایگاه داده را با استفاده از NCBI E انجام دهید.
• یاد بگیرید که چگونه از داده‌های ترانسکریپتومیکس برای NGS و تحلیل فراخوانی واریانت استفاده کنید.
• یاد بگیرید که چگونه از زبان R برای بیوانفورماتیک استفاده کنید، پکیج‌ها را نصب کنید، نمودارهای جذابی با ggplot2 بسازید، با RNA تک‌سلولی آشنا شوید و تحلیل داده‌ بیان ژن را انجام دهید.
• یاد بگیرید که چگونه از پایتون برای بیوانفورماتیک استفاده کنید، از کتابخانه biopython برای تحلیل توالی، کار با ژنوم‌ها، فیلوژنتیک، پروتئومیکس و یادگیری ماشین استفاده کنید.
• بیاموزید که پایپ‌لاین خود را برای تحلیل RNA-Seq و فراخوانی واریانت با استفاده از لینوکس بسازید.
• بیاموزید که کدهایی برای R و پایتون برای خودکارسازی تحلیل‌های بیوانفورماتیک بسازید.
• تمام کدها و پایپ‌لاین‌های استفاده شده در دوره در دسترس همه دانشجویان قرار خواهد گرفت.

پیش‌نیازهای دوره

• دانش اولیه زیست‌شناسی: درک مفاهیم بیولوژیکی مانند ژن‌ها، پروتئین‌ها و ژنوم‌ها
• مهارت‌های اولیه کامپیوتری: توانایی کار با کامپیوتر و آشنایی با نصب نرم‌افزار
• درک اولیه آمار: دانش مفاهیم آماری اولیه مورد استفاده در تحلیل‌های بیوانفورماتیک
• آشنایی با مفاهیم برنامه‌نویسی: درک اولیه از مفاهیم برنامه‌نویسی مانند متغیرها، حلقه‌ها و توابع
• آشنایی با رابط خط فرمان (CLI): دانش اولیه استفاده از خط فرمان برای کارهایی مانند ناوبری و دستکاری فایل‌ها

توضیحات دوره

با «بوت‌کمپ کامل و عملی بیوانفورماتیک: از صفر تا قهرمان» به دنیای بیوانفورماتیک سفر کنید! این بوت‌کمپ آموزشی جامع برای دانشجویان، دانشگاهیان و متخصصان صنعت طراحی شده که به دنبال گسترش درک خود از داده‌ بیولوژیکی و پیشرفت در زمینه بیوانفورماتیک هستند.

دنیای بیوانفورماتیک را از طریق نمایش‌های عملی و کاربردی بررسی کنید که تئوری را با کاربردهای دنیای واقعی پیوند می‌دهد. یاد بگیرید که چگونه در پایگاه‌های داده بیولوژیکی جستجو کنید، توالی‌ها را هم‌تراز کنید و داده‌ ژنومیکس را با استفاده از ابزارها و تکنیک‌های پیشرفته تحلیل نمایید. به بررسی دنیای پروتئومیکس، بیوانفورماتیک ساختاری و تحلیل‌های تکاملی بپردازید تا اسرار پنهان بلوک‌های سازنده حیات را کشف کنید.

دوره ما به گونه‌ای طراحی شده است که شما را به مهارت‌های اساسی مورد نیاز برای تبدیل شدن به یک تحلیلگر داده محاسباتی عالی مجهز کند. شما به ده ماژول کلیدی خواهید پرداخت:

• پایگاه‌های داده بیولوژیکی
• هم‌ترازسازی توالی
• بیوانفورماتیک ژنومیک
• بیوانفورماتیک پروتئومیک
• بیوانفورماتیک تکاملی
• بیوانفورماتیک ساختاری
• بیوانفورماتیک خط فرمان (لینوکس برای بیوانفورماتیک)
• بیوانفورماتیک ترانسکریپتومیکس
• زبان R برای بیوانفورماتیک
• زبان پایتون برای بیوانفورماتیک

این ترکیب منحصربه‌فرد از تئوری و کاربرد عملی، شما را قادر می‌سازد تا با اعتماد به نفس با داده‌ بیولوژیکی کار کنید. با 103 درس، شامل آموزش‌های عملی، 10 تکلیف، 11 آزمون و یک پروژه نهایی برای ساخت پایپ‌لاین بیوانفورماتیک خود برای تحلیل داده‌های RNA-Seq در bash، درک جامعی از ابزارها و تکنیک‌های بیوانفورماتیک به دست خواهید آورد.

از پایگاه‌های داده بیولوژیکی گرفته تا ساخت پایپ‌لاین خود برای تحلیل داده‌، ابزارهای متنوعی را که به صورت رایگان در دسترس و مرتبط با مطالب دوره هستند، بررسی خواهید کرد. برخی از ابزارها ممکن است نیاز به ثبت‌نام داشته باشند، اما بیشتر آن‌ها بدون هیچ‌گونه ثبت‌نامی قابل دسترسی خواهند بود. تمام کدهای استفاده شده در GitHub در دسترس خواهند بود.

در پایان این دوره، داده‌ بیولوژیکی را با دیدگاهی کاملاً جدید خواهید دید. ما معتقدیم که این سرمایه‌گذاری در آموزش شما ارزشمند و پاداش‌دهنده خواهد بود. این فرصت را برای تحول مهارت‌های بیوانفورماتیک خود از دست ندهید.

همین امروز در این دوره شرکت کنید و اولین قدم را به سوی تسلط به بیوانفورماتیک بردارید!

این دوره برای چه کسانی مناسب است؟

• دانشجویان: دانشجویان کارشناسی یا کارشناسی ارشد رشته‌های زیست‌شناسی، بیوانفورماتیک یا رشته‌های مرتبط که می‌خواهند مهارت‌های بیوانفورماتیک خود را بهبود دهند.
• متخصصان: متخصصان شاغل در زمینه‌های زیست‌شناسی، ژنتیک یا بیوتکنولوژی که می‌خواهند بیوانفورماتیک را برای تحقیقات یا پیشرفت شغلی خود یاد بگیرند.
• پژوهشگران: دانشمندان و پژوهشگرانی که می‌خواهند بیوانفورماتیک را در پروژه‌های تحقیقاتی خود بگنجانند.
• تحلیلگران داده: متخصصانی که با داده‌ بیولوژیکی کار می‌کنند و می‌خواهند ابزارها و تکنیک‌های بیوانفورماتیک را برای تحلیل داده‌ یاد بگیرند.
• علاقه‌مندان: افرادی که علاقه زیادی به زیست‌شناسی و بیوانفورماتیک دارند و می‌خواهند این زمینه را بررسی کرده و مهارت‌های جدیدی بیاموزند.