آموزش علم داده ژنومی و خوشه‌بندی (بیوانفورماتیک 5)

توضیحات دوره

چگونه می‌توانیم بفهمیم کدام ژن‌ها فرآیندهای مختلف سلولی را تنظیم می‌کنند؟ انسان‌ها چگونه از آفریقا مهاجرت کرده و در سراسر جهان پراکنده شدند؟ در این کلاس، خواهیم دید که این دو سوال ظاهراً متفاوت را می‌توان با استفاده از تکنیک‌های الگوریتمی و یادگیری ماشین مشابهی که از مسئله کلی تقسیم نقاط داده به خوشه‌های مجزا نشأت می‌گیرند، پاسخ داد.

در نیمه اول دوره، الگوریتم‌هایی برای خوشه‌بندی گروهی از اشیاء به مجموعه‌ای از خوشه‌ها بر اساس شباهت آن‌ها معرفی خواهیم کرد که یک مسئله کلاسیک در علم داده است و خواهیم دید که چگونه این الگوریتم‌ها می‌توانند بر روی داده‌های بیان ژن اعمال شوند.

در نیمه دوم دوره، ابزار کلاسیک دیگری در علم داده به نام تحلیل مؤلفه‌های اصلی (principal components analysis) را معرفی می‌کنیم که می‌توان از آن برای پیش‌پردازش داده‌های چندبعدی قبل از خوشه‌بندی استفاده کرد تا تعداد ابعاد را بدون از دست دادن بخش زیادی از «سیگنال» موجود در داده‌ها، به شدت کاهش دهیم.

در نهایت، شما یاد خواهید گرفت که چگونه از ابزارهای نرم‌افزاری محبوب بیوانفورماتیک برای حل یک مسئله واقعی در خوشه‌بندی استفاده کنید.