یافتن پیام‌های مخفی در DNA (بیوانفورماتیک 1)

توضیحات دوره

این دوره توسط دانشگاه کالیفرنیا، سن دیگو به عنوان یکی از 50 دوره برتر MOOC تاریخ شناخته شده است!

این دوره، مجموعه‌ای از کلاس‌ها را آغاز می‌کند که قدرت محاسبات در زیست‌شناسی مدرن را نشان می‌دهد. لطفاً در مرز بیوانفورماتیک همراه ما باشید تا پیام‌های مخفی در دی‌انِ‌ای را کشف کنید، بدون نیاز به پوشیدن آزمایشگاه یا لباس سفید.

در نیمه اول دوره، به موضوع هم‌ترازی دی‌انِ‌ای می‌پردازیم و سوال می‌پرسیم که کجا در ژنوم، فرآیند نسخه‌برداری دی‌ان‌ای آغاز می‌شود. می‌فهمیم که می‌توانیم این سوال را برای بسیاری از باکتری‌ها با استفاده از الگوریتم‌های ساده پیدا کردن پیام‌های مخفی در ژنوم پاسخ دهیم.

در نیمه دوم دوره، سوالی دیگر در حوزه بیولوژی مطرح می‌شود؛ وقتی می‌پرسیم کدام الگوهای دی‌ان‌ای نقش ساعت‌های زیستی را ایفا می‌کنند. سلول‌های بدن شما توانایی حفظ ریتم سیرکادین را دارند، اما این چه طور در سطح دی‌ان‌ای انجام می‌شود؟ باز هم، می‌بینیم که با دانستن پیام‌های پنهان باید به دنبال چه الگوهای بگردیم، می‌توان زبان پیچیده دی‌ان‌ای را شروع به فهمیدن کرد. شاید عجیب باشد، اما از الگوریتم‌های تصادفی، که در آن، تاس می‌ریزیم و سکه می‌چرخانیم، برای حل مسائل استفاده خواهیم کرد.

در نهایت، با ابزارهای نرم‌افزاری موجود، دست به کار شوید و الگوهای زیستی تکراری در داخل ژن‌ها را بیابید که مسئول کمک به قابلیت «خواب رفتن» مایکو باکتریوم توبرکولوزیس هستند، تا سال‌ها درون میزبان باقی بمانند و سپس عفونت فعال ایجاد کنند.